Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC71Q8IV32 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms