Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms