Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms