Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF550Q7Z398 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms