Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms