Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms