Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms