Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD40Q6AI12 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms