Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms