Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms