Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF20Q5VTR2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF20Q5VTR2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms