Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms