Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGD3Q5JSP0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms