Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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