Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms