Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms