Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms