Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF8Q3BBV2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF8Q3BBV2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms