Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM21Q3B7S5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM21Q3B7S5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms