Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms