Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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