Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms