Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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