Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms