Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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