Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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PCM1Q15154 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PCM1Q15154 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PCM1Q15154 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PCM1Q15154 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCM1Q15154 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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