Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAPTM4AQ15012 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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