Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GAPVD1Q14C86 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GAPVD1Q14C86 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GAPVD1Q14C86 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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