Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms