Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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