Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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