Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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