Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1AQ13111 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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