Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTP4A2Q12974 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTP4A2Q12974 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTP4A2Q12974 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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