Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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