Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB40BQ12829 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB40BQ12829 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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