Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms