Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms