Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms