Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FPGSQ05932 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FPGSQ05932 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms