Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms