Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB1P82279 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms