Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFI35P80217 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFI35P80217 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFI35P80217 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFI35P80217 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms