Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms