Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GNB1P62873 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GNB1P62873 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GNB1P62873 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GNB1P62873 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GNB1P62873 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GNB1P62873 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GNB1P62873 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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