Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms