Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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