Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME5P56597 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME5P56597 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME5P56597 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms