Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTTPP55157 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTTPP55157 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTTPP55157 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms