Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEMP55040 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GEMP55040 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEMP55040 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms